El arte del bonsái es solo una extensión de la cultura de las ‘plantas en macetas’ en la jardinería. Todas las plantas de fructificación, floración y follaje deben podarse regularmente para obtener frutas y flores de calidad en grandes cantidades y también para mantener las plantas sanas. Las plantas en macetas no pueden vivir toda su vida en la misma maceta a menos que se poden sus raíces y se cambie el suelo. A menos que se haga esto, es difícil mantener los árboles en buen estado de salud. El objetivo principal del bonsái es cultivar y mantener los árboles con buena salud y cultivarlos hasta el final de su vida útil. Por lo tanto, es incorrecto decir que el arte del bonsái es cruel con las plantas y los árboles.
Bonsai no es un proceso de enanismo de árboles normales. El estado enano de un árbol se debe a variación genética o mutación. Los árboles enanos naturales son débiles y de corta duración. El arte del bonsái consiste en miniaturizar árboles y plantas normales a través de diversas técnicas de poda, cableado, defoliación, etc. y hacerlos crecer en un entorno diferente, como un pequeño recipiente poco profundo. El árbol resiste el nuevo entorno y crece bien una vez que se podan sus ramas y raíces. Esto es posible solo con ciertas especies de árboles que pueden adaptarse a un entorno diferente.
Los árboles atrofiados son aquellos árboles normales que se han retrasado en su crecimiento debido a la falta de nutrientes y nutrición y a la falta de cuidados adecuados durante un largo período de tiempo. Los árboles enanos son árboles que son significativamente más pequeños que sus árboles originales estándar debido a alguna mutación genética que ha tenido lugar o mediante ingeniería genética mediante la cual se crea una planta que son miniaturas genéticas permanentes de especies existentes. Los árboles en miniatura son aquellos árboles normales que se hacen pequeños en tamaño mediante el uso de diversas técnicas de cultivo como poda, cableado, macetas, defoliación, reducción de raíces para producir árboles pequeños que imitan la forma y el estilo de los árboles maduros de tamaño completo.