Los organismos vivos contienen miles, si no cientos de miles de moléculas diferentes. Los organismos vivos funcionan a partir de químicos basados en carbono. La mayoría de las moléculas formadas a partir de carbono no absorben la luz visible. Los químicos orgánicos (aquellos que estudian compuestos orgánicos) trabajan principalmente con compuestos blancos aburridos y envidian secretamente a los químicos inorgánicos que trabajan con complejos metálicos de colores brillantes.
Es posible formar compuestos a base de color a partir del carbono por conjugación (como en la melanina) o por complejación en un metal (clorofila, hemoglobina), pero es la excepción y no la regla. Además, las moléculas que están coloreadas absorben la luz (excluyendo las moléculas birrefringentes), lo que las hace propensas a sufrir daños por la luz y me imagino que son menos adecuadas para crear un organismo vivo funcional. Por lo tanto, puede haber presión de selección contra moléculas coloreadas. Por supuesto, también existe una presión de selección para las moléculas coloreadas donde la absorbancia de la luz confiere una ventaja evolutiva, como la recolección de energía de la luz (clorofila) o la protección de otras moléculas del daño de los rayos UV (melanina).
Creo que la razón por la cual un solo compuesto es generalmente responsable del color de un organismo vivo es porque (1) los compuestos a base de carbono coloreado son raros (2) los compuestos coloreados son menos estables que los compuestos no coloreados y (3) los compuestos coloreados que están alrededor son allí porque transmiten alguna ventaja evolutiva.
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