La respuesta directa a su pregunta es no: no hay separación entre el universo y nuestros cuerpos. Independientemente de si consideras que todo está hecho de átomos u ondas.
Los átomos dentro de su cuerpo se han producido dentro de las estrellas o muy temprano en la formación del universo y lo más probable es que hayan formado múltiples objetos u organismos vivos a lo largo de la historia hasta terminar en su cuerpo. De hecho, la configuración de los átomos en su cuerpo no es constante, y a medida que consume alimentos agrega nuevos átomos a su configuración (si se absorbe en su cuerpo) y expulsa otros átomos. Este flujo constante hace imposible distinguir dónde comienza y dónde termina su cuerpo. Cualquier separación tendría que ser puramente arbitraria y considerada en un momento particular en el tiempo.
Parece que todos somos gotas individuales de agua en un océano, como si nuestra individualidad o separación solo estuviera en nuestra mente.
Sin embargo, esta pregunta lleva a otra intrigante: ¿nuestras mentes están separadas del universo?
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Sin embargo, para responder eso, primero tendríamos que saber cuáles son nuestras mentes, y hasta ahora no he visto una respuesta convincente e integral a esa pregunta, y tampoco tengo una sólida que ofrecer.